重磅！華大基因HALOS PMseq一體機(jī)升級(jí)發(fā)布！
2024-10-21
隨著健康中國(guó)戰(zhàn)略的深入實(shí)施，我國(guó)醫(yī)療服務(wù)體系正朝著流程更高效、信息更準(zhǔn)確、服務(wù)更便捷的方向發(fā)展。信息化工具則成為了當(dāng)下各級(jí)醫(yī)療機(jī)構(gòu)實(shí)現(xiàn)更高效優(yōu)質(zhì)服務(wù)的重要渠道之一。為承載醫(yī)院日益增長(zhǎng)的信息分析需求，華大基因于2018年自主研發(fā)了可實(shí)現(xiàn)本地化獨(dú)立運(yùn)行的基因分析一體機(jī)“HALOS”，為醫(yī)院構(gòu)建了可本地化高效運(yùn)維的基因分析中心，集計(jì)算機(jī)、軟件、數(shù)據(jù)庫(kù)于一體，與高通量測(cè)序儀等設(shè)備實(shí)現(xiàn)無(wú)縫鏈接，可對(duì)臨床檢測(cè)樣本的測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行自動(dòng)化分析、注釋和解讀，并生成準(zhǔn)確可靠的報(bào)告結(jié)果，具備基因高性能計(jì)算的可靠性、可移植、智能化等優(yōu)點(diǎn)；真正實(shí)現(xiàn)病原高通量測(cè)序項(xiàng)目在院內(nèi)進(jìn)行本地檢測(cè)到出具報(bào)告的閉環(huán)，樣本和數(shù)據(jù)安全可控，為臨床提供一站式高質(zhì)量服務(wù)體驗(yàn)。
在《宏基因組測(cè)序病原微生物檢測(cè)生物信息學(xué)分析規(guī)范化管理專(zhuān)家共識(shí)》中提到“實(shí)驗(yàn)室應(yīng)有獨(dú)立的高性能服務(wù)器用于mNGS，不可與其他計(jì)算需求共用”，“考慮到數(shù)據(jù)安全，推薦本地服務(wù)器部署，離線更新”[1]?！恫≡昊蚪M高通量測(cè)序臨床本地化檢測(cè)規(guī)范專(zhuān)家共識(shí)》也明確指出“如有條件，建議實(shí)驗(yàn)室優(yōu)先使用本地服務(wù)器進(jìn)行數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)和管理”[2]。
HALOS PMseq一體機(jī)
華大基因自主研發(fā)的HALOS PMseq一體機(jī)是一款專(zhuān)門(mén)針對(duì)病原高通量測(cè)序檢測(cè)的智能集成化本地生信分析服務(wù)器，內(nèi)置PMseq®病原宏基因組高通量測(cè)序和PTseqTM病原靶向高通量測(cè)序兩款專(zhuān)用分析軟件，是解決疑似感染樣本本地化生信分析和報(bào)告解讀的一套整體的解決方案。
HALOS PMseq一體機(jī)與病原高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)過(guò)程自動(dòng)偶聯(lián)，無(wú)需專(zhuān)業(yè)的生信分析人員，一鍵智能生成報(bào)告，結(jié)果準(zhǔn)確且數(shù)據(jù)安全，功能全面，可實(shí)現(xiàn)全流程信息數(shù)據(jù)智能管理，真正做到病原高通量測(cè)序臨床實(shí)驗(yàn)室本地化，助力臨床疑難危重感染性疾病的快速早期診斷
HALOS PMseq 全新升級(jí)
華大基因HALOS PMseq一體機(jī)從上市至今不斷進(jìn)行功能和內(nèi)容優(yōu)化升級(jí)，現(xiàn)再次迎來(lái)重大升級(jí)！
升級(jí)亮點(diǎn)
- 內(nèi)置PMDB數(shù)據(jù)庫(kù)全面升級(jí)：病原物種升級(jí)，病原物種從原17,500種擴(kuò)充至36,000余種病原體及代表性耐藥和毒力基因，同時(shí)對(duì)分析流程和分析時(shí)長(zhǎng)進(jìn)行優(yōu)化，增量不增時(shí)。
- PMseq®報(bào)告模板全新升級(jí)：增加檢測(cè)結(jié)果匯總，報(bào)告內(nèi)容更加直觀清晰；肺支耐藥點(diǎn)突變檢測(cè)結(jié)果納入主報(bào)告、增加檢出病原覆蓋度圖等；報(bào)告內(nèi)容、檢測(cè)指標(biāo)更加合理全面。
- 增加PMseq?CNV分析功能：新增染色體拷貝數(shù)變異 (CNV) 分析功能，在常規(guī)病原檢測(cè)流程完成后，支持滿足條件的全部或篩選指定樣本進(jìn)行宿主CNV補(bǔ)充分析，提供CNV風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估，挖掘患者潛在的腫瘤風(fēng)險(xiǎn)。
- 新增統(tǒng)計(jì)中心：全新統(tǒng)計(jì)功能，可實(shí)現(xiàn)對(duì)檢測(cè)項(xiàng)目整體情況、送檢樣本分布、病原及耐藥毒力基因檢出陽(yáng)性率和檢出頻次、重點(diǎn)關(guān)注病原檢出等統(tǒng)計(jì)功能，2小時(shí)自動(dòng)全量更新，高效數(shù)據(jù)管理。
- 解讀中心優(yōu)化：增加自動(dòng)化輸出結(jié)果標(biāo)記，以便與人工判讀結(jié)果進(jìn)行區(qū)別；協(xié)助樣本便捷解讀審核與修改。
系統(tǒng)優(yōu)勢(shì)
- 資質(zhì)齊全：內(nèi)置國(guó)內(nèi)NMPA首批認(rèn)證的二類(lèi)和三類(lèi)病原專(zhuān)用分析軟件 (鄂械注準(zhǔn)20162212303、國(guó)械注準(zhǔn)20203210062) 及多項(xiàng)專(zhuān)利技術(shù) (專(zhuān)利號(hào)：ZL201510125249.X、ZL201710994066.0和ZL201720756216.X等) 的核心智能算法，嚴(yán)格保障檢測(cè)質(zhì)量。
- 專(zhuān)業(yè)全面：全新升級(jí)臨床級(jí)別核心PMDB V7數(shù)據(jù)庫(kù)，可一次性檢測(cè)細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲(chóng)等36,000余種病原體及代表性耐藥和毒力基因。新增CNV分析功能，有助于鑒定感染病原體的同時(shí)，發(fā)現(xiàn)患者潛在的腫瘤風(fēng)險(xiǎn)。
- 功能強(qiáng)大：含PMseq®和PTseqTM軟件套餐，可同時(shí)用于mNGS和tNGS數(shù)據(jù)分析；系統(tǒng)涵蓋樣本管理、任務(wù)管理、分析解讀中心等多功能模塊，新增統(tǒng)計(jì)中心，可實(shí)現(xiàn)全流程信息數(shù)據(jù)智能管理。
- 靈活高效：支持建立本地參考文獻(xiàn)庫(kù)和背景菌庫(kù)；支持個(gè)性化報(bào)告模板配置；支持病原比對(duì)序列自主下載；支持his/lis系統(tǒng)對(duì)接。
- 簡(jiǎn)單易用：真正無(wú)人值守，測(cè)序數(shù)據(jù)自動(dòng)推送到一體機(jī)，自動(dòng)分析，智能出具報(bào)告；UI界面，交互設(shè)計(jì)，可快速上手操作；高性能配置分析時(shí)長(zhǎng)0.5-2小時(shí)，平均每份報(bào)告用時(shí)3-5分鐘。
- 安全可靠：數(shù)據(jù)信息安全保障，具備3級(jí)網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)安全證明；本地化網(wǎng)絡(luò)設(shè)計(jì)，數(shù)據(jù)不出院，無(wú)需上傳云端，有效防止數(shù)據(jù)泄露；嚴(yán)格賬戶權(quán)限設(shè)置，最大程度保證數(shù)據(jù)安全。
HALOS PMseq基因數(shù)據(jù)分析一體機(jī)全流程管理
解讀中心 智能報(bào)告 輕松解讀
統(tǒng)計(jì)中心 定時(shí)更新 高效管理
PMseq®病原微生物測(cè)序?qū)＜蚁到y(tǒng)整體解決方案
病原體mNGS檢測(cè)本地化進(jìn)程的推進(jìn)，對(duì)病原基因檢測(cè)流程的智能化和自動(dòng)化提出了更高的要求。華大基因?qū)⒊掷m(xù)精進(jìn)打磨HALOS一體機(jī)，不斷升級(jí)優(yōu)化助力臨床精準(zhǔn)診療輔助決策。
華大基因作為病原微生物高通量測(cè)序領(lǐng)域的領(lǐng)先企業(yè)，以感染防控基礎(chǔ)研究及臨床應(yīng)用服務(wù)為核心，堅(jiān)持創(chuàng)新，不斷加強(qiáng)和完善感染分子診斷全場(chǎng)景的系列產(chǎn)品布局，技術(shù)涵蓋宏基因組技術(shù)和靶向測(cè)序技術(shù)等，建立從社區(qū)復(fù)雜感染、院內(nèi)感染、癥候群感染到疑難/未知/免疫缺陷感染的全套本地化產(chǎn)品解決方案，助力臨床對(duì)感染性疾病進(jìn)行針對(duì)性治療，最大程度降低患者死亡率，協(xié)助醫(yī)生合理用藥，助力感染性疾病的精準(zhǔn)治愈。華大基因關(guān)注病原檢測(cè)技術(shù)的同時(shí)，更致力于從實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量管理體系建設(shè)、技術(shù)轉(zhuǎn)移、軟硬件建設(shè)、人員培訓(xùn)等方面為醫(yī)療機(jī)構(gòu)提供整體的解決方案，實(shí)現(xiàn)更全面細(xì)致的病原基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室服務(wù)，助力病原基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室的建設(shè)和高效運(yùn)行。
參考資料
[1]. 中華醫(yī)學(xué)會(huì)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)分會(huì). 宏基因組測(cè)序病原微生物檢測(cè)生物信息學(xué)分析規(guī)范化管理專(zhuān)家共識(shí). 中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志, 2021, 44(9), 799-807.
[2]. 中國(guó)藥師協(xié)會(huì)，中華醫(yī)學(xué)會(huì)細(xì)菌感染與耐藥防治分會(huì)，國(guó)家衛(wèi)生健康委臨床抗微生物藥物敏感性折點(diǎn)研究和標(biāo)準(zhǔn)制定專(zhuān)家委員會(huì). 病原宏基因組高通量測(cè)序臨床本地化檢測(cè)規(guī)范專(zhuān)家共識(shí). 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志，2023，DOI: 10.3760/cma.j.cn112150-20230720-00019.
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